【编者按】为了更好地营造校园学术氛围,传播牛宝体育学术科研动态,牛宝体育在校园网开辟“科技前沿”专栏,定期总结、回顾牛宝体育师生取得的科研成果。欢迎广大师生及时把自己的学术科研成果以邮件的形式告诉我们,我们希望获得您以下成果信息:为政府、企业、媒体进行了专业咨询;科技成果通过了相关鉴定;科技成果落地、实现产业化;发表了高水平的学术论文;获得了专利授权;出版、编著了专著、教材;获得了科技奖励;在重要学术会议上进行了发言……
我们愿意为有学术追求的师生搭建一个交流的平台,希望在师生的努力下,牛宝体育的学术氛围日益浓厚,让我们为实现电子信息特色鲜明的高水平大学而奋斗。联系邮箱:dwxcb@guet.edu.cn。
近日,计算机与信息安全学院樊永显教授课题组在生物信息学领域国际顶级期刊《Briefings in Bioinformatics》(JCR Q1区,中科院 Mathematical & Computational biology小类一区TOP,IF=9.5)上发表了题为 “EGPDI: identifying Protein-DNA binding sites based on multi-view graph embedding fusion“ 的研究论文,由郑梦鑫(第一作者)、孙贵聪、李雪萍共同完成,樊永显教授为通讯作者,牛宝体育为该论文的唯一署名单位。
蛋白质-DNA相互作用的机制涉及广泛的生物活动和过程,准确识别蛋白质和DNA之间的结合位点对分析遗传物质、探索蛋白质功能以及设计新型药物至关重要。该论文提出了一种基于多视图图嵌入融合的新型计算方法EGPDI,通过结合等变图神经网络和图卷积网络,优化了全局和局部节点嵌入表示。采用门控多头注意力机制更精准地捕捉关键信息,额外引入的蛋白质语言大模型,进一步丰富了其表示学习能力。独立测试和案例分析均验证了该模型的优越性和泛化能力。
该计算模型的潜在应用广泛,可用于开发更精确的个性化药物治疗方案,通过针对特定蛋白质-DNA相互作用的抑制剂来治疗遗传病和癌症。在基础生物学研究中,此模型能够提供对蛋白质功能和基因调控机制更深入的理解,从而推动生命科学的研究进展。